Due to a planned NERSC power outage, JGI portals will be unavailable 6:00am PDT July 10 - 11:59pm PDT July 14. System Status updates available here.
Transcription Factors • Pleosporales
Annotations/GenomesAalte1Aaoar1Alalt1Alalte1Albra1Altal1Altalt1Altar1Altbr1Altca1Altcar1Altci1Altcr1Altda1Altfr1Altga1Altli1Altlo1Altma1Altpo1Altro1Altso1Altta1Altte1Alttom1Amal3063Amal3064Amnli1Ampqui1Ascra1Bimnz1Boeex1Bysci1Clael1Cloaq1Cocca1CocheC4_1CocheC5_3Coclu2Cocmi1Cocsa1Cocvi1Corca1Cucbe1Currey1Decga1DelFL0756_1Delco1Denna1Didex1Didma1Dotsy1Epini1Fenfe1Herpot1_1Karrh1Lenfl1Lepmu1Linin1Lopma1Lopnu1Macan1Maseb1Masph1Melpu1Ophdi1Parch1Parchr1Parsp1Perma1PhaPMI808Phapo1Phomu1Photr1PlePMI138_1Plesi1Polfu1Pyrly1Pyrsp1Pyrtr1Pyrtt1Setho1Settu3Settur3Spofi1Stano2Stasp1Stely1Trepe1Veren1Wesor1TotalAnnotation Description
Transcription Factors
43375046341330059558427629337842644138837542039944445038032951837641443540440842952135539751364649843753449250752549849149251569551147643638037065245445343553556964856756836949064066350048445964954872971260776355556662753851449056568375836438548947048033931967037957546635844,894
1210111211121410111211121291210121299121112121412141311111112101111131313141516151212912101013141111121212101410111213121010101113111012171312121510101213111212141481216121211121,078Helix-loop-helix DNA-binding domain
610664116454554453364265554539559578119889888109694687476577861291098679911886768981161191012558101151097641Homeodomain
187523181282271556161520191717172322131131181621171719711719662567592161646858605965907318652057295916632123286269517479326365208079353870812722287632587741907055652022574797198765544,004Zinc finger, C2H2 type
15111514111016116141312146151216151481413121514131381112819991399999911811158126111115816131498889151111121110151510101414161115971310898131366101281051,023bZIP transcription factor
109332129111722402145479991121101029710599112117987918497105110106961072041181032042581951582011721851921791791821833031981801471251172701651291571972172572352411161922792631971821672902122882782573582032112492021841942212653269210716316116896812759723418311015,827Fungal Zn(2)-Cys(6) binuclear cluster domain
8128881310711910119991011997989987814772181414101515151314131519138161219814614987141812121661310713157813188661910121461314131510815121281813151,023Myb-like DNA-binding domain
4444244324544444443244343444444444444444444444444444444444444444445444544444445445554444444361Forkhead domain
2222221222222122221111222121122122222222222222222222122222222222122323221222222232222222222172SRF-type transcription factor (DNA-binding and dimerisation domain)
5766676655556556565465556556667676567766766676766757767765686667787766777666768567566566776555GATA zinc finger
11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111411111111111141111111111112197Transcription factor TFIID (or TATA-binding protein, TBP)
3333233323333233333333332332333333333433333333323333333433333333333343333333233333333233333268HSF-type DNA-binding
6966767577878767885666779787787788778788999910107910898681089971097811781367118671257987987888687888706HMG (high mobility group) box
2222211212212222212121222222122222212222222222222122222222222331212121222222221222121122160Copper fist DNA binding domain
7676577457667776676577577768666667777777676767777767666766686766667766666766877677777576666587Histone-like transcription factor (CBF/NF-Y) and archaeal histone
2422322122222122222213454446553242211123434242433114133413211312322170PAS fold
11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111190G10 protein
11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111175TEA/ATTS domain
111111111111111111111111111121221222222221211112211121111222112222211221221112112221122120Helix-turn-helix
333333323333213333232333233333333333433333333333333333333333333333333433333323333333333333264ARID/BRIGHT DNA binding domain
32422212221132221122322212212412332222121283NF-X1 type zinc finger
1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111189TFIIE alpha subunit
2222122112122222221112221221111212111111111112112111112111112111211111111211311111221111111122CCAAT-binding transcription factor (CBF-B/NF-YA) subunit B
2141111521213411211311172191211422015161617171911186134111121111422318161018213143121831923433221122331420181612181416113916779AT hook motif
1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111189STE like transcription factor
111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111191RFX DNA-binding domain
111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111188Transcription initiation factor IIA, gamma subunit, helical domain
121111111111111111211111111111121211121111111111111112112111111111112111111212111111111111100Paired amphipathic helix repeat
11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111190Transcription initiation factor IIA, gamma subunit
1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111165DDT domain
23222212222222222222222222232222222222222222222222222222223222232222222222225222222222222184MIZ/SP-RING zinc finger
11111111111111111111111111111111111111111111111148C5HC2 zinc finger
111112111113111111111211111111111111111144FAR1 DNA-binding domain
1111211111111111112111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111191SART-1 family
11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111112111111111111111111111121189PHF5-like protein
111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111191Transcription initiation factor TFIID subunit A
111111111111111111121111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111192Transcription factor Tfb2
3233323313333333333333333332332322322222222232323232333221223223223322333232232122332223222226CBF/Mak21 family
111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111185CCR4-Not complex component, Not1
13219514011785128160756310512913310911512512413313911711013011013113112012713410281114971799179126108112115113104103111157961167985601589113683139147157122107739013015610210410013810920220014016613714916510012410411018219276821141241274868152117113835410,816Fungal specific transcription factor domain
2222222222222122222222122112222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222178NOT2 / NOT3 / NOT5 family
111122213111112121111111111111111111111111111111111111162CENP-B N-terminal DNA-binding domain
11111111111111122111121111112111111112212121111111121111166Putative FMN-binding domain
1221121111111111222121212211111111212211222160KilA-N domain
11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111190CP2 transcription factor
111111111111111111111111111111111111211211211111111111111262Mating-type protein MAT alpha 1 HMG-box
2222222122222121222132221222222222222322222222222222222222222222222222222222222222222222222179SNF5 / SMARCB1 / INI1
1111111111111111111111111111111111111211111111111111111111111